wikiOpenChrom
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OpenChrom ist eine Open-Source Software für die massenspektrometrische Analyse chromatographischer Daten, basierend auf der Eclipse Rich Client Platform (RCP). Der Fokus von OpenChrom liegt auf der nativen Verarbeitung von Datensätzen unterschiedlicher Hersteller sowie Analysesystemen (z.B. GC/MS, LC/MS, Py-GC/MS, HPLC-MS). OpenChrom ermöglicht den Import von binären als auch textuellen chromatographischen Daten wie zum Beispiel *.D Chromatogramme von Agilent Technologies, mzXML oder NetCDF.
Projektinformationen
- Projektname: OpenChrom
- URL: http://www.openchrom.net
Projektbeschreibung
OpenChrom bietet eine anschauliche grafische Benutzeroberfläche und ist für Windows, Linux, Solaris und Mac OSX verfügbar.
Die Funktionalität zum Erkennen von Basislinien als auch zur Detektion und Integration von Peaks ist enthalten. Filter ermöglichen zum Beispiel das Entfernen von bestimmten Massenfragmenten (m/z) wie Stickstoff (28) oder Wasser (18). Weitere Filter, Detektoren und Integratoren können durch den modularen Aufbau nachträglich hinzugefügt werden.
Weitere Informationen
- http://sourceforge.net/projects/openchrom/
- OpenChrom: a cross-platform open source software for the mass spectrometric analysis of chromatographic data (ausführlicher Artikel von Philip Wenig zu OpenChrom in BMC Bioinformatics)
- OpenChrom (de.wikipedia.org)
- OpenChrom Build Server (www.openchrom.de)
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Autor: Werner Fischer Werner Fischer arbeitet im Product Management Team von Thomas-Krenn. Er evaluiert dabei neueste Technologien und teilt sein Wissen in Fachartikeln, bei Konferenzen und im Thomas-Krenn Wiki. Bereits 2005 - ein Jahr nach seinem Abschluss des Studiums zu Computer- und Mediensicherheit an der FH Hagenberg - heuerte er beim bayerischen Server-Hersteller an. Als Öffi-Fan nutzt er gerne Bus & Bahn und genießt seinen morgendlichen Spaziergang ins Büro.
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